Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Q1T7F1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -1
Q1T7F1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
Q1T7F1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
Q1T7F1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Q1T7F1 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Q1T7F1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
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