Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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