Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC18A3Q16572 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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