Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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GRIK5Q16478 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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GRIK5Q16478 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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GRIK5Q16478 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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GRIK5Q16478 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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GRIK5Q16478 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK5Q16478 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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