Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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VAMP3Q15836 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP3Q15836 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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