Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms