Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNHIT3Q15649 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNHIT3Q15649 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNHIT3Q15649 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNHIT3Q15649 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNHIT3Q15649 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNHIT3Q15649 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ZNHIT3Q15649 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms