Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRADDQ15628 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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