Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms