Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms