Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LAPTM4AQ15012 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms