Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMD6Q15008 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms