Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCAPHQ15003 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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