Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GAPVD1Q14C86 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
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