Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHPRHQ149N8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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