Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRCAPQ14761 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms