Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCARF1Q14162 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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