Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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