Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPM6BQ13491 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms