Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP140Q13342 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP140Q13342 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP140Q13342 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP140Q13342 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP140Q13342 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP140Q13342 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP140Q13342 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP140Q13342 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SP140Q13342 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SP140Q13342 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SP140Q13342 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SP140Q13342 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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