Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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