Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRN3Q13033 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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