Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms