Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms