Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELP6Q0PNE2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms