Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms