Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms