Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXM1Q08050 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms