Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC3A1Q07837 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC3A1Q07837 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms