Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PAX8Q06710 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms