Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNB3Q05901 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms