Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms