Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX2Q04743 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms