Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F1Q01094 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms