Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFAMQ00059 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms