Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM193AP78312 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms