Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6V0D1P61421 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms