Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2E1P51965 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms