Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3BP49841 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms