Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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