Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALDH9A1P49189 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms