Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD97P48960 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD97P48960 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD97P48960 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD97P48960 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD97P48960 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD97P48960 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD97P48960 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD97P48960 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD97P48960 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD97P48960 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD97P48960 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD97P48960 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD97P48960 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms