Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NESP48681 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NESP48681 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NESP48681 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NESP48681 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NESP48681 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms