Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RANGAP1P46060 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms