Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPOP42166 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPOP42166 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms