Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX11P35716 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SOX11P35716 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX11P35716 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX11P35716 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX11P35716 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX11P35716 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX11P35716 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX11P35716 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX11P35716 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX11P35716 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms