Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP214P35658 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP214P35658 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP214P35658 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP214P35658 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP214P35658 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP214P35658 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP214P35658 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP214P35658 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP214P35658 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms