Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms