Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VARSP26640 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VARSP26640 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VARSP26640 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VARSP26640 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VARSP26640 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VARSP26640 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VARSP26640 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VARSP26640 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VARSP26640 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VARSP26640 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VARSP26640 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VARSP26640 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VARSP26640 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VARSP26640 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VARSP26640 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VARSP26640 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VARSP26640 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms