Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TACR1P25103 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TACR1P25103 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TACR1P25103 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms